;ID VANDAL11 DNA ; ATH ; 14166 BP ;XX ;DE Autonomous DNA transposon VANDAL11. ;XX ;AC AL109819 ;XX ;DT 31-MAR-2000 (Rel. 5.4, Created) ;DT 31-MAR-2000 (Rel. 5.4, Last updated, Version 1) ;XX ;KW Autonomous DNA transposon; transposase; VANDAL11. ;XX ;OS thale cress ;XX ;OC Arabidopsis thaliana ;OC Eukaryota; Viridiplantae; Charophyta/Embryophyta group; ;OC Embryophyta; Tracheophyta; euphyllophytes; Spermatophyta; ;OC Magnoliophyta; eudicotyledons; Rosidae; Capparales; Brassicaceae; ;OC Arabidopsis. ;XX ;RN [1] (bases 1 to 14166) ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RL Direct submission (March 2000) ;XX ;CC VANDAL11 is a fossil of an autonomous DNA transposon. ;CC Two 88% identical direct repeats (positions 10690-10816 and ;CC 10817-10943) flank 506 bp region which is 99% identical ;CC to the portion of the chloroplast genome. We removed ;CC this region since it is very likely that it does not ;CC belong to the transposon. ;XX ;DR Positions 3937 18608 Accession No AL109819 GenBank (rel. 116.0) ;XX ;SQ Sequence 14166 BP; 4901 A; 2759 C; 2766 G; 3740 T; 0 other; VANDAL11 tattttaatttctatgctcagtcgaaccgaaaataaaagaagtaagcatgataagttagaaattagcttc tctcttgtgtgacatatttttgtaccaaaaatatccctataacccggagtaaacgataactaattgtagc gtagctgtttaagcatttaacgccgtagagatttacgaagattcactcgccgattttggaaacataaaat atattgggggaaaatattgtgatcattacaaatatatttcgagttgcgggaatatcagccatatacattg ggttatcctatttattaccgttgtactaacttcaaccaacaaaaaactagcagactaacaacttaaattt ccgataattttaatgcaagcaaaagctaggaacccagaaaattcaaagcagagacgtaaaagtaaaagat ccaagtattttgtaactgatagttaaatgtttggaagctactttttttaccttagggtttgcaagattat aatagaaaccgataactaacttgttatttctgaaactatttcaggtacaaatggcgttcgtggtgagatt gatacctggggagtggaaaagagatgaaaacggaattttcgaacacatctcgcatgtagatgggtttgaa ttcggagtccgactgcgtgagagagatagttttgcgaagattgttatggcgggaaaagatagattagcgt tagggccagatgacgatatcgagttaacgtaccagtggccacagtggatgctcggtcctgattggaaacg agcgaacccaattgacatattggatgacgaagatacgacactgttcgtggctattagggcatatctggat gaagtgcatctgctagtgaagattatacgaggtggaaatgttcgaaacgttaatagttaccgcagtaaca tggatctaagcggtttgagttcgaaagaaatatcggataaatactaaaattgtgcggaaacaagagctgt atggggtaccgcgttaaccagaatgctgttgcgtaacctctcgggtaaacctcaaaaccacgttaatgat aatatttaagttatcaaataagttggatatctgttaataatatttagatttcaggagacggacaagatat agcaaccatgggggacaccaacgacgtcggcatacgtaaagagattgaataacacaacccgtatggaggt gtcatcataagggaaaacacggagattgcagcggagactagcgagacgccatcgaaagtaccacaaccag gggcaattacaagtttgaaaggcaaagagaaggttatagatgacgatgagagagaaaaagatcgtttatt cgaggtgtggagaacaaatcaacaagaagcaatgttgcgtgaaatgtgttcaagagaaatgtcgctaaaa gggagtcaaccgagtgaaacaaacggatgcgataaagagaagacagcgagagcactagacttcggaagta catatcatgcaaacgacaatgaaattgaaaatttgcatttgacccttgtaggggcagaatcgcaagctgt tggaccacaaatagtcgcattgtcttcaagtgattcaaccttcgggacgccaacttcgatatcaacgagc gtttctttctgcagcgaagacctaatggatgatactgactcttccgacagccttagcgtatcggtgatag gtttgttaacaaataacatgtttggtaactgataagtttttaaactgttactcgcatttatcgactaacg tgtttcgtaatgtaggtgatgagactctgtcccacttttattctgacgccgatggcccactcattgaaaa tcctcaacccatcaccatgagggataaaggaaaagatatcatgatagagaatgccttaccgagtgaagtt gttggattggtctccaatacctcaagagtattggagatgtagagaaatgcaatgaccgtaaaggatatag cggttgcgacggtcttgtatgaccgagatgctccgccatattttgacgatcaagggaaggaaggtaaaaa aaaaaatcaacttgctaaatatattgttagatagctacaactgttgttatcgtcaggaaagcaagaagtt aaaagtatatctatatattatcatacatatagaagagtatgtgtttatcgttagcgacagataacaacat taataaaagaaaactttatcttcaactttctatatctctctagtaataatattatcgaatgcattaacat atcgttaacgcctgattcgttgattgacttgcagatgcccttcagcgagccctgaaggatgctgattacg aggggggtgacatttacatcagccgcatttttaagaataaagaggattgttcaactaagctcgctattca tgcgatccggaggaagttccatttcatttacgtaaagtccgggccaaatgttgtggcggctgtgtgcgtc agccatacatgtccatggtgggtttatgcaactaagctgccagatagtgatacgttcgaggttaggagca cgacttcaacacacacgtgtagcgtggatgctaaaggggacttccacaagcaagcatcaacggctgtgat tgggaagttgatgggaactaaatacataggagtgggccgtggacctcgacctaatgagcttagaagaatg ttacgccaagagtttaacctcaacgtctcttattggaaggcatggaggacaagagaaatagcgatggaca atgcaatggggtctgctatggggagttacgctctaaaccaaccatactttaagctgcttttggagacaaa tcccaactcacttgtggcaatggaaactgaaaaggatgcttcaggggtagagagattcaagtacttgttt tttacccttcatgcctgtgttctaggctatccttacatgaggaaggtgatagttatcgacggtacacacc tacggggacgatatgggggatgtttagttgcagctagtgcgcaagacgccaatttccaaatattccccat tgcatttggaatagtaaacagcgagaacgatgaggcgtggacttggttcatgactaagctgacggaagct attccagatgatcccgagttggtgtttatgtcagataggcattcctctatttatgccagcatccgcaagg tatggaattaatctctatgttatccgataatgtggggtttaccatcaggctttttatgtttacataagcc tttttgtactgtaacaggtttaccccatgtcatcacatgctgcttgcatcgtccacctcaagagaaacat tgaggcatactttaaagtcgaacagttaagtgccttggtatcaagtgcagctagagcttatcggctaact gacttcaacaagatttttgctgaaattaaggctacgcatggatcgtgcgctgagtacctggaaagtatag ggttcgaacattggaccaggtcacattttgttgggaatcggtacaacttcatgacgagtaatattgtcga gtcgctaaacaatgttttaacggcagcccgagattatccggtaatctcaatcttagaatctatccagaca accctcgtatcatggtttgcgtttcgtaggcaggcagcccagttagaagacaatatcttgccgcctaaag tacataacatggttatcgagaattttgagaagggggcgggttttgttgtgataaagattggggatggtct ctatgaggttagagacaaaagaggcggagggtttgtagttaacctattggagagaacatgtacatgcaga gagtttaagcttctaacgattccttgctctcacgcaatagtggcggccatacaagaaggactccgagtgg acacactggttggggttcatcacaccacgccacagctacggttgtgttaccaagccctaataatgccggt gcctgacacggagactcttactccgtcaccaaacgatgtaggggggggagaactggctccaccgtatgtt tcaaggcctccgggaagaccaaggaagcgatgtgaaagctttaaattattgaacgctaatcaggatatct gatatacaataactatacaataataacttctgttacttttgtaaaagacttcaaggaaaagatgttcgcg ctgcaagtcgttgggccataacagggtaacctgcaatggaccaataacggtaagaattataatatcgcga ttacatatatgttacttgatatttaaagggtggaattgtactgcaggagacataagagaaggggaggatc acgtttttttgcgctgaaagttgtgggatggatgttgccaggattaacagaatctggcatggcgatgtga aataaataatacgggggaagggttcagaaaattttcattgtacatgcgtatgacatctgttccctaaatg taaaattatcggtacgaatccaactatcatgaagtaatgtttcatataatggcagtatgtggtatgtttt tgtttactgagttatctctgactttaacctactaactaaagaagataatactaaccggaaaaaatcgcat cgaaatgatatcgtgatacaaatcatgataatctattaactttagttgataagcctaatgtcgcgaaaat aatgtaacgcctgtcattggtataatcacgatgttggtactcctaaaagaagacaaggacacctagtggg tcgagttattaaggacatcaatcagaataatcataacgcgtgttatctgataacaaaaaaaaaacataaa tatgtacttgtccccataccgggatagattcactagtgaatattaacataaatttattgcccggctttgt aggagttgcaatcaaagcaataaacacccgagttgtttttacaaaaaagtaaaacagctatattgtataa ctgataataataacattacctatacgctgaatgttacatatcttcggaccgaatcaagtaaaaggttcgc ttttttaaatatatatcagtatattcatgtatcggctaatttacgtatccgagttgataagaatatttat aattgtcacaacgtctaattgtccccagatagatattacttcggtttggttcatgaagccgacaaagaaa cagtgacccagtcacaatgaaaccaaaccaagccgtacagctacaaatataacccgataattgccgtgag tattccagggttataatcccccaaattaaaaacagaagaaccctaatttggaaccagaacccgaaatttg gaaccaaaattcttcgacaaaggatgagcagtctatcatcaagttcgactggatctacagggccgcgggg taaaggtaaagttgtaggaataccgaaaatatgttggtgcggggaaggagtcgtgtcactcatttcaaaa tcggttccgaatccttgccggacatattatcggtgtgattttgctgcaaaaaatagggtaaatgctgcta atcttgttcatctgattattctatttcttcaattgccatgtttaattcgctgttaatttggaaaatctat gttaatacctagctaagaaacgacgaccacacttttaaattggttgacgaagctttgctcaatgagatag agacattgacagcaaagacacgagacattgagcaagagctgaaagatcttcggggacagaggtccgagtt cgaaaagatggtttacgagaacgtggaaatgaagatagaaaaagaagtgcttacgaaagtggaagaagct gtgtctcaaacgaaagcgagcagtaagaggttgatgattgtgatggtgttagggtgtatgatcatacttg gatacaccaaacttaaaggggaagtagtgtagaataatatttacactttgttgtagtagtcagcgggata atattgtgtctgctaaccttcgctctagtagaataatatagggactatagtgtatctgctaacgctgcaa tatagaccaacggttggagtgagataaaatctcgagaacttgttattaagataaacgttagtaattaaaa tgtatttgaaatcgacgttgataatgtaagataacaacaaagttagctagtaacctttacgctgaaaagg gataatatagtatctactaccgcaatcctaatgcaacgatccgagtctggtcaaaatccacgaattttaa aaacaatgagtaacaatgataacaacaatgttagcgagaaaatctctaatatggaataatattgggataa tagttaatctgctaacgcgagtcgaatgcaacgatgataaatatcccacaatgcttaccgagatactgca acactaaccatttaaatcggctaatctaatatcagataacttattattatctactaccgcaatcttaatg caacgatccaaggctggtcaaaatccacgaattttaacaacaatgagaagcaatgataacaaaaacgtta gcgaggaaaatctctaatatagattaatattggaataatagtatctctgctaacgcgagtcgaatgcaac gatgataaatatcccacaatgcaacgatactgcaaaactaaccatatattattaacttagtagataactt attattaagtaaatacaaacgttagctgctaacaatatcgaggtacacgacgtaaacaaaacagaatcgg ataactaggtgtaagacaaaagctaaacgcagttagaaaaacgctgggaaacaaaaaattgtaaagttgg gtgacaaaaaagtttgctagtaaaacgttatttagtaattctgcgctaaatcaacaatccgagtctggta aaatcctacaaaatggtaataatacataacaataatattttttaaaaagatattggataacgtgataaca ttatatctgatattattattagtgatacatgcgaagacaaaatcaacgaattgaaaaaactattaaaaac agagataaacgacaaacgttatctgataacaacgatgacaaatatacaacaatgcaacgagaatacaaca ttaagcatttaaaacggctaatcttatatcagataacgtaatattaggttaataacaaagttatatacta aacaatatcgaggtgctaaacgtacacaaacagattcggataactaagactacgacaaaagcttcacgca attagaaaacggttggaaacaaacattgtaaagaagggtaacaacagagttagctagtaacccccaccaa tattaaggccgacactagctttttaacttcacactgaagaccgtcgacctcaaattccacacattcagtg acaccacctgtggcgtgagtgtggataaggaatatagagaagatgcctgtatcgagtggggaagcaacct gcgggatgactagtggtcgctctatagaaaacggatccatcgaacagttcctcttagacgaattgaaagc agcctgttggaaaaggaatgacaacattaccgcgagtggcatgatctcgtcctgaatagcagaatctttg cgtcgttgaatgttcgaatccaagacagttatctttcgacagttcaaatcaacagctaaagccacccaat gcttcttgtcaaagttaaatggcaggtacaggaaatcagcctccgtgaataattcgatatgatcaggttc tccacggccattaaagagatcaatcagatgaggtgggaactgaaaatcttgtttagaagagcatcgagaa aatttggggaatagacggaacaatagtgagacgaacttagaatcaaggacatcgacacgaagtttatgac catcggcatcatcggttcttaacaaatgccgactaaacttgatgagagcatccattacctgggtgataaa ggaaagagaaacacccaacatattacaaaacaatatgttaaatctttaagtattctaatatataatgaca gaacgtaccttgcttgttagattcttcttccgatcagtcaaatccaaaatttctttattggtcaaagcaa cacccccacaaatgctaattgacctattgcaaaccaatacgtcgataaaagattaccaattgcaaaaata acaatattttatgtgctaacaacaaacaaatgggataaagaataccttatcgccttaagtttcttcatgg agttttgaaatcgttcttctgtgtcgacaaggtcgttgcctttattgacaacaagggatggatgacccac taaaatcttggttttcttaccatacgcgaagcgaccatctagcttggtagatagagtacggagacgctta cttcttctcccacaaattccatcagcgttgttagcattcatatcatcctgctactaactggcattattaa taaaaggtggcaaatcatatttaggttacaaaaaaaaaattacagttgacgagatatgcatgggttaaga tcttagcctcttttgaaggagggaggggtggtggtaaaatcctaaaagattaagcatattaaagtaaaca tgtaaccaatattatatcagatatacaattaggggatatacctcggggatatacctcatctgaatccggt gcagaacgagtcaattgaataaaaagtaagaattagatagttatagcaattaggagataattaaaatatt agtaggaaacaaaacccaaacaccttgaggatagaagacacaactgagggggtgcccctgccaacatcct gtcaaaacagttcaaaaatgagaattaccgataaaaaaacttatggaaataataacatacgatgtgtagt tacacattaacctgttcataaaatctcttaatagggtcacgaccgtcgccggtataacaatcgttaccgc catattcctgatacaatacaacggttccacaaaatacaacttactgtaaaaggggagatgaaactttgaa atcaaaagtgttttgcgtaaccataacacgaccgcaacagaactagcatccaaatacaatgttataacac taatgatggcatgtagtaacttccaaacaataacaacacaacaacatgatagactctgagacaaattaaa actgagcataaattaaaaaaacgattaattttaattttatttgccggtggttggtttaccactcatggtt tttattttaaaattataaacgatctactcagtaataaagcatttgcccaacttaaagactgaacataaat agaactcaaattccaaactaaaaaaaggtttacttaactcctaacatcgctatcattgaaaacttaatct ttacaagtagaagagtaggtaaacgctggagaaaagcgtaaggaggtaacaacattatgggtgctagttt agctgctaaccaaaatatccggaaactccgcggtcacatcaacaccaaccattccatcatcagtcgcggg ggcaacctaatcgacgatgagttcaaatagtgaagccagattcaaacacataaaaaccgtgctagtatga aatagacgtgttacctggccatcttctccagcattcgtcaattggcttacagaaccacctgcaggctggg aacattgaacctagcgcatgaaacaacacaactttggataaaacaaccgacagagcaaaatacggcatta tgaggataatatctacgccgctaacttccacgttatcgagagattcctctacgttatcgagagattcctc tgggtttacaaccgtttcattggatgaaaccttgtaaccagacttttaaacatatgaaaaatatgtaatc aacaggattcaacaagggagtatgtaaagcagaattacaattaaaaagagaaattcagtttaatgtttct ttataaaacaaacctcattacacaccactgcaggggggatgtcgtctaccacgaaatcagtattagcgtc ctacaaagatattttttccaacattagggtcgggataatagagagaaatgcaattcgttgaaacactaat cacaatactaagatcttaactccttacctctggcgtatctttatccgcatcaacgttgactacgtcagca acaactcgatttggtgcctacagcacaaatgaacacattaacagctacccaactcattatctgctatgtt acattacctaatccataaaatgtttggagtaatcaaagtgtatttaaatataattaattgctatccaaca catctcattgccctccagattgggggggagtccgtcaacacatgaatctatgttatttggctaataacaa attacgacaacggttattgtcaaggcaacgtaatcgaaatacaattcgttaacaacccatttgacatgct aagagacatatcagctaacctcttgacttccaccgtcaccaaagtttgtaccaaaatcagctcctacaaa gactgggccctacaaaaccaaaataacaacaaaattataatcccccagttgcgttagtggctaatataac tgttaaacatgtaagtgacataatgattactataattactgactagtgacttcacttccgttggaaaagg tctcacctcggaatcgtgaatcacgtcagcctcggctagttgatcttccgctacagcatcagatgagacg ttttcttctacctgtacccataagaaaaaaaaacgatgtgaaaagatgacaccgcaatgattgagtaaac cagaaacacctagagcagtttaagaaactgcaatccacaaaaataattatacactaaaaaaaagattatc gtcaattaccattttctcagtaggatcagaggcatctgtgacatcattaacgccctgcaaaacaattaag gcgattgtttgtaatattcataagcatcataatccatacactaaaaaatagattatcatcgattaccatt ttttcggtagggccagaggcatccgtaacatcgttagcgcccggcaaaacaattaaggcgattgtttgta atatccatgagcatcacaatccaaacccctccccccaatggatatttaatagatatgggaacagttagtc actaaataaaataacgcctaacaatttaattaacttaaacaaactaaccaccaaaacccaagtttaagta actacagtccacaaaaacaattatccattaaaaacgagattatacaccattaccactttatcggttggat cagagacatccgtaacgtccttggcgccctgaaaaaaaaaaataaagcgcacatgaatattttatagata tgctaacagttagtaactacataaaatgacgcttaagaagttaataaacttaaacaaaccaacccaccaa tacgtgcgggctcaattggacctcggatcggatatggtcttccattggagcaacgttgtcacgctaagaa aaaacgaaaaaaattctcagaattataactcaaaacaatcattgccttgataacaatttgtaaaaaaagt taggtgaagtcatcaacgcaatcatggcagaaaaagacaacagataagacagtttaaaaagactacaatc aaaaaaaaagaaaaaagaaaaactcacgccagggttatcttcggattccattatatcaaaagtagcaggc ccctctctaacattgttagcagcctgcacaacaatagaagataataattttcaactatttaaaataacaa ctaaaagatgagttaactgctacaaaaaaactaactgatgggtttggactcatgtcacctgaggatcgaa catcatctcccactggctcaacattgtcgcgctaataaccacaaataacacccgcttgatattatacata tattgtgccagttatgaactatttagaataacaccttagtagtaatttatcgggaaaaaaacctacctgc acgttcgggctcaagccgccagcagatcgaacatcgtcttccactagctctacaatatcgcgctaaaaac ccaagaacaaaaataaactgaggacatatccagcaaaaaaatttcatatgttgtaagtgacttcccaaaa ttacctccgacacgttgagcccaacaccacttggaaccttgtctgtgtagtaagacaaaatctcatccac actagactgaacattcgaattcctttgacggccattagaaccaacattagaagatggccggcggagagca tcaaacccaaaatcatcattgggctcattccgacccacctcttcaggattagaaacacccccactagccg gatctttggaaagtccaccttcaatgacaatgtttataatgaaccaatccataagcgcaacaatgattaa tttcccctgcgcttcaagctttttgtccaacaaacgggaaatagaatccatagaaacggtccctgaacta ctaccttcctctggaacgggtctttgatgtttggtcctgaccctactagtgttctttgatggtttgcctt tcctgttccgaccaccatttgacttaacacaccttttttgttttttggaagccaattgcatctgtgatgg gaaacatccaccaccaaacatatcattcttgaaaataagaccctgctcagccaatattaaaatattatcg actctctcatcttcatcgtcttcagaccacgacaaatcttcctcagggtccagatcaaggtcagggcaaa taatagtagcaacacgaacctgcaatagtgaatcccgataacaaaatcagtcagataacttgattaatgg tgagcacgcttagtggttaactatgaagatgtcaccattgctaacagataacaaaataaccgacaatact attatcgagttttactaatagaccattgtatggtctcgcgtgttgaaaccaactactgtgttaaacaata acaagtttaatgaataatagtattaccgagcatttagcatccagctccttcgcatgccctagcttgaaag cgacggaatcacgaggggcctcttcgaaattgtcttcagcctcttctgatttttgactcaatggtctcac caactacatgaccttcttgaatagatggggctgcttgtaataccaccaactgcaacgcgtacaacagacc ctgaacaacaaaacaggtactagcaagttgttaaatttccctctctttaatcgactttatcatcatctcg aatgtgaaacggcttcatggataagagagaaatgcttcaacatcctcagccatttcagcgtgagccttaa caatcttgggatagtgcgaggtagggacaagaaagccgtcgacaatggccaaacaagcacatctgatcct catgccgggatctgagataatccttctcttcaacattgtaatcacccggtcaacagttacatcttcttca agcccaaacagcttattgtaaaatggtatcctcttccccgcagtgcctttcttcctcttcatcttcaagc tcggatattttccacactgtaacccgataactatcttgaactctctcaacgaaaagcgaataggagtgcc ggcaaataaaacccatatctcattcggtttcgcaacttccaactgcctacccagaatgaaaattctaaag ctcgcggaccacgcgagtagtttggggaattccaacaagcgaccgaacgaagatcgagcaatgaactgcc gctctccatcgtctagggcattgataacacaccacataaggttttcattttctgatacacgttgaccctc tcgtcgtgtggttcttcacgaaacgcaatcagtcggggagggagagggagaggcgccatcttcctacaaa agaaacaaacaaagccattagtcaacaaatgaaggactgatgacaaaaagaggggaaaaaatgaacttac tataacgtttgtcaggaaaaatcccagatctgagagacgagttgatgatcgaaaataaaaactgccgaaa aagctaatttttgggaaagttgctctgatgatttcttccgcctccaaaccgtcattcatgatatataaac ttgaaaagtagcgaccgttcgataacaagctaattaaaaaaaaacatcacacctccccaaaaaaatctag agagaatcaactcctacactctagcaataatatcgtctacgctctactcctctcgatatcgaaatcatag gggtacatgcgtaatctttgagttaacagtagctggggaactgttaagaaaaatgcgacctaaataatga atcctctgggcatacgcaatgatatt1