;ID ATREP5 DNA ; ATH ; 2386 BP ;XX ;DE Non-autonomous Helitron DNA transposon - a consensus. ;XX ;AC . ;XX ;DT 24-FEB-1999 (Rel. 3.2, Created) ;DT 24-MAY-2001 (Rel. 6.2, Last updated, Version 3) ;XX ;KW dispersed repeat; non-autonomous DNA transposon; HELITRON class; ;KW ATREP; ATR3; ATREP5. ;XX ;OS consensus ;XX ;OC Arabidopsis thaliana ;OC Eukaryota; Viridiplantae; Charophyta/Embryophyta group; ;OC Embryophyta; Tracheophyta; seed plants; Magnoliophyta; ;OC eudicotyledons; Rosidae; Capparales; Brassicaceae; Arabidopsis. ;XX ;RN [1] (bases 1 to 2388) ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RL Direct submission (February 1999) ;XX ;RN [2] ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RT Molecular paleontology of transposable elements from ;RT Arabidopsis thaliana. ;RL Genetica 107 (1-3), 27-37 (1999) ;XX ;RN [3] (bases 1 to 2386) ;RA Kapitonov,V.V. ;RL Update (May 2001) ;XX ;RN [4] ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RT Rolling-circle transposons in eukaryotes. ;RL Proc Natl Acad Sci USA 98(15), 8714-8719 (2001) ;XX ;CC Individual copies of ATREP5 are ~97% identical to the ATREP5 consensus ;CC sequence. ATREP5 shares common structural features with other ATREPn ;CC elements which belong to the HELITRON superfamily. All these elements ;CC have conservative termini: 5'-TC and CTAG-3'. ATREP5 copies have been ;CC inserted precisely into the AT target sites, without duplications and ;CC deletions of genomic DNA. ;XX ;DR [3] (Consensus) ;XX ;SQ Sequence 2386 BP; 952 A; 251 C; 334 G; 848 T; 1 other; ATREP5 tctatatatacatttttggaggggatttttgaagataatgttgaagatttgagccataattcaacaatta attcaaatgggtgggttttacccggtttaactctgttcggatcctggataacatgtttaattctgttctg atcttggataacattaatttttggaaaagttacctaaaaactaataattaaaaacgaaaattaatgattt aattaccaaatttaatataaacaatatctctaaactaaccatatttcttatttaccttaactaatttcct aaaatatttctacctaatttaaacataaatatataattcttctttcayttttatttgatcttatacttta tttattttgaatttatataaaatatatatagttaataaaatattatatttttttctgaatatgatgtaat tcaaattttttaaaacggacatatattattcaacctatgaagaaataatatgtgtacaatgtcccacatc gcttagaaaaattggacaatggttcagacccatattataaaaggaccaaaatgattctgattacgaatga gcaggaagcttgatttatcaggcgtccaaaattaaaatagttatccgattttactcggattttttatttt aaagaattgaaactttaaaatgtttcaagaaattataaatattataactttatcaaaagttaaatattat aattttaaaaactttttataaagtttatctttaaaaaatgctttaaatatttataattttaaaacttata aagttttaaaaattataaattgaattttacaagaaatttaaacattataaatatataaaaaatatattaa tacgagacgatatattacaggaaaaatcttaaatataacaatcaaaattcaatgatgaattttgggtcga tattgtattttttttaagtttcaaattttataatattgaaatttataagaaaatgacaaaattatgttta atttcacgggactgggttatatggtaggacgggtttgggtggataataattacgattttacaatgtccca catcgcttaaaaaaattggacaatggtcaagagccatactataaaaaggaccaaaatgatttcgattacg aatgagcatgaaacttgatttatgaggtgtccaaaattaaaatggtttgtttactagggttatttatttt aaaaaattgaaactttaaaaagtttcaaaaaattataaattaaattttacaagaaatttaaacaatataa aagatattaatacgggacgatatactgcgagagaaatcttagatataacactcaaaattcaatgatgaag tttgggtcaatattaatcttttttgaagtttctaattttataaatatttgaaatttataataaaatgaca aatttgtgtttaatttcacgggacggggttatatggtgtgacgggtttgagtggataataacatgggata gtatgctatggaaaaaaacatataattaacaatcataatataattatataatcttaaacactaaacaaaa ttaacaatattaaaaaaaaacacttaaaactttaatttttttaaaacacattttgattcttttataagaa atttaaacattataaatatttaaactttatactacgggtgaaattttagaattgactgtttgggttgata agaatttgcgatagaactaggagttaaatcctagaatgacaatcaaaatataattatacaattaaatact accacgagtgaaatcctagaattgacgagtttgaatcgatattaatatgggatggtgtactacgggtgat attttagaattgactggtttgggttgataataatttgcgatagaattaggagtgaaatcctagaatgaca attaaaatataattatacaattaaatactaccacgggtgaaatcctagaattgacgggcttgattcgata ttaatatgggatggtgtactacgggtgatattttagaattgactggtttgggttgataataatttgcgat agaattaggagtgaaatcctagaatgacaattaaaatataattatacaattaaatactaccacgggtgaa atcctagaattgacgggtttgattcgatattaatatgggatggtgtactacgggtgaaatccgagaaaca acaatcaaaatacaattatacaatattaaacatttaacaaaataaacaaatacaacttaaaactttaaaa tttgagttataaaatttcgtctcgcggtgaattatacatttaaatcaaacaatagcataaatttattaaa tcatcctaaaaaatattcaattattttttatttaataaaaatataggcccgcggtataccgcgggttaat atctag1