;ID ATREP4 DNA ; ATH ; 2240 BP ;XX ;DE Non-autonomous Helitron DNA transposon - a consensus. ;XX ;AC . ;XX ;DT 24-FEB-1999 (Rel. 3.2, Created) ;DT 24-MAY-2001 (Rel. 6.2, Last updated, Version 3) ;XX ;KW dispersed repeat; non-autonomous DNA transposon; HELITRON class; ;KW ATREP; ATR2; ATREP4. ;XX ;OS consensus ;XX ;OC Arabidopsis thaliana ;OC Eukaryota; Viridiplantae; Charophyta/Embryophyta group; ;OC Embryophyta; Tracheophyta; seed plants; Magnoliophyta; ;OC eudicotyledons; Rosidae; Capparales; Brassicaceae; Arabidopsis. ;XX ;RN [1] (bases 1 to 2242) ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RL Direct submission (February 1999) ;XX ;RN [2] ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RT Molecular paleontology of transposable elements from ;RT Arabidopsis thaliana. ;RL Genetica 107 (1-3), 27-37 (1999) ;XX ;RN [3] (bases 1 to 2240) ;RA Kapitonov,V.V. ;RL Update (May 2001) ;XX ;RN [4] ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RT Rolling-circle transposons in eukaryotes. ;RL Proc Natl Acad Sci USA 98(15), 8714-8719 (2001) ;XX ;CC Individual copies of ATREP4 are ~94% identical to the ATREP4 consensus ;CC sequence. ATREP4 copies have been inserted into the AT target sites, ;CC without duplications and deletions of genomic DNA. ;XX ;DR [3] (Consensus) ;XX ;SQ Sequence 2240 BP; 922 A; 276 C; 213 G; 822 T; 7 other; ATREP4 tctatattattaattgggaagcattgtgtgaactacaacattgtaagggtagtttaaaactaactaaatg aatttttgcatgggtaatttagtaaattaacaactactacaactaaataaatatcttggattttgttctt twaaaaaaacgaatttaaaatcaataaattaataactacccaatattttcggaaatcatttaaaaacgtt tccataacatatcaggctattttaattcgaattgtatatatgtaaacttatttattttggtaatatgtta ttagataattcggaaacttcaatctaatttaataacaaattatcatttagtttagattttatacaatttc cttaacaaaactatgttaattgtttctgattagtacacataaaaaataattttaaattatgatttagcat attcaaaagagaatttttggattttagatttgtaattatctagaaaatagtttcagtatagattaaaata tttaacattttaattagaatttaaatgatataaacttttaaagtatttttttaaaacaggtaattttcat tattttaaaaatatatcactaagctaaatttgaattatataaaagaaaatatatttttaaacgtattata atagttacaagcttttggaatattcattcttctagattcgattatttctttttttttaaacagtaaaaca aagtttaaataccaatgtttaaaatttttaatgcaaatattcaaaatgagaaaatattgattcacaccaa tatyttatttttttctttgaaatttgaatgacttttttttggaacaaacagtaatatgatttttttgaca gatcattaattgtattcgaacaataataactaccatatttgcgataatgcataaggataagtttaatttt aaaaaataccaaaatcgttgagatcatagtaaattttagctttaaaaaaaaatattttcgtcatcctaaa tttaaaatatgtaattcagattagtttttttcagtaaagctaagattgaatccaaattaaaatctaattt tgcgtacaatctatctcttataattataaatgttatgcatacattcacattgcctcacaatcaatctaga atatcgattctttaaaaaaaatagatagagattcataagtaaattacttcatgttctaatgatgtttatc tcctaattttactatccatttatgcgtattcttatggatttttctttcagggtcaacactagattacaag aaactagccgggtgttggtcaatattataccacanataaaatcatggaattaacaatcaaaatatagtta tacaatcttaaacaataaacaaaacaaatataacttaatttaattttttatttttaactaaaatcaacaa atttatyagtttataaaaaacaaaataaaaattagcacgtggtaccctacgggtaaatcactacgatttc atgaggttgcaatatcaatttatacaaattttgacttttaaaatatactttatacaattattgaaaggta tacactaaaaatcggttttatatactacaatatcataaatttataaatcacaaattatttttaaatatat taatccaagatgtaccacatgtcaatccctcgatttttttaatatattacaataacaatatttaaaaata acaaaataatatttaattttacggaatgaagttatatggtggaacgagtttgggttgatattaatacggg acgataatctacgagtgaaatcttagaattaacaattataacacaattatacaatcttaaacactaaaca aaataaacaatatttacaaaacaactataacttaaaattygaatttttagttacaaaaaaatcgaccaac ggtgtaccgcggagtaaattttacattatatcatctaattgatcaaatttcaaacaaaaacaattaattt atatatacatcaaactaacaaaaatacacagattttccaaatatctctatattattccgcaaatcgaaac aaatctaacaatctatttactatgcaaaatacaaataaaatataaataatataaattaataaaaaaaatt agctattgtatcataaataacactatacacttttctatgcacattataatttatacactayaatatcttt cactaaaaatgtattccaatayatttcttaaaatatgaaaccccgcacgtatgtgcgggtcagaatctag 1