;ID ARNOLD3 DNA ; ATH ; 14724 BP ;XX ;DE Autonomous DNA-transposon ARNOLD3. ;XX ;AC AF096371 ;XX ;DT 08-APR-1999 (Rel. 3.2, Created) ;DT 08-APR-1999 (Rel. 3.2, Last updated, Version 1) ;XX ;KW Autonomous DNA transposon; transposase; ARNOLD; ARNOLDY; ARNOLD3. ;XX ;OS thale cress ;XX ;OC Arabidopsis thaliana ;OC Eukaryota; Viridiplantae; Charophyta/Embryophyta group; ;OC Embryophyta; Tracheophyta; euphyllophytes; Spermatophyta; ;OC Magnoliophyta; eudicotyledons; Rosidae; Capparales; Brassicaceae; ;OC Arabidopsis. ;XX ;RN [1] (bases 1 to 14724) ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RL Direct submission (March 1999) ;XX ;RN [2] ;RA Kapitonov,V.V. and Jurka,J. ;RT Molecular paleontology of transposable elements from ;RT Arabidopsis thaliana. ;RL Genetica 107 (1-3), 27-37 (1999) ;XX ;CC ARNOLD3 is an autonomous DNA transposon. It is bordered by a perfect ;CC 9 bp-long target site duplication. This DNA transposon does not have ;CC terminal inverted repeats. It encodes MUDRA-like transposase and ;CC one/two additional proteins in direct and reverse orientations, ;CC respectively. The additional protein includes a transmembrane ;CC domain related to the one present in proteins from the drug resistance ;CC translocase family (also known as the major facilitator family). ;CC This structural feature links ARNOLD3 transposon with bacterial ;CC transposons many of which are well known to be cariers of drug ;CC resistance genes. ;CC ARNOLD-like autonomous transposons are/were responsible, putatively, ;CC for a proliferation of ARNOLDY-like non-autonomous DNA transposons. ;XX ;DR Positions 23139 37862 Accession No AF096371 GenBank (rel. 109.0) ;XX ;SQ Sequence 14724 BP; 4598 A; 2699 C; 2139 G; 5288 T; 0 other; ARNOLD3 gaataattcactctaatgcccttttctcaatgcccttttgcaactctaccctttttttcccattttcatt tctaccctttctaatacttttctccccaaattacccttaatgagctacccacagacctaattcatttctt cactctctctcttcttcctccatcgcaaattgtgaatgccgttgaatcccatgccgtcggaaatagtgag tttactcgccgtgaaaactcatcttcgccgtcgtaagtagagctgtgtgtcgccgtcgaatctcttgcgt ttcccaggtttgattttataatgttagcttaaattttcgttttcgaattggtttattcgatttttgttat 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